超声波细胞破碎仪通常由以下部分结构组成：

- 超声波发生器：是仪器的核心部件，负责产生高频电信号，为整个破碎过程提供能量基础，一般采用数字控制技术，可精确调节频率和功率，以满足不同实验或生产需求。

- 换能器组件：

   - 换能器：将超声波发生器产生的高频电信号转换为机械振动，是产生超声波的源头。通常利用压电陶瓷等材料的压电效应来实现电信号与机械振动的转换。

   - 变幅杆：可将换能器产生的振动有效地传递到液体中，并对振动幅度进行放大或缩小，以适应不同的样品和破碎要求。

- 样品容器：用于放置待破碎细胞的样品，一般由高强度聚合物或玻璃、不锈钢等材料制成，需能承受超声波产生的振动和压力，其设计要便于样品的加入、破碎操作和取出，常见的有样品杯、试管等形式。

- 冷却系统：由于超声波破碎过程中会产生大量热量，可能导致样品温度过高而影响实验结果甚至损坏设备，冷却系统用于降低设备和样品温度，常采用循环水冷却或风冷散热的方式。

- 控制系统：用于调节超声波的频率、时间、功率、占空比等参数，通过准确控制这些参数来实现最佳的破碎效果，通常具有触摸屏或按键操作界面，方便用户进行参数设置和监控破碎过程。

- 隔音箱（部分型号配置）：为了降低超声波破碎过程中产生的噪音，一些型号的超声细胞破碎仪配备了隔音箱，采用特殊隔音材料制成，可有效隔绝噪音，保持实验室的安静环境。